Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt39Q6IFX4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt39Q6IFX4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms