Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scaf8Q6DID3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scaf8Q6DID3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scaf8Q6DID3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms