Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY9

BC080695, cDNA sequence BC080695, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC080695Q66JY9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC080695Q66JY9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
BC080695Q66JY9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
BC080695Q66JY9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
BC080695Q66JY9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC080695Q66JY9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC080695Q66JY9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC080695Q66JY9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC080695Q66JY9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC080695Q66JY9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC080695Q66JY9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC080695Q66JY9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC080695Q66JY9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC080695Q66JY9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC080695Q66JY9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC080695Q66JY9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC080695Q66JY9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC080695Q66JY9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC080695Q66JY9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC080695Q66JY9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC080695Q66JY9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BC080695Q66JY9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC080695Q66JY9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms