Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Surf4Q64310 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms