Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Zfp248Q640N4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp248Q640N4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp248Q640N4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp248Q640N4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp248Q640N4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Zfp248Q640N4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp248Q640N4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp248Q640N4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp248Q640N4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp248Q640N4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp248Q640N4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Zfp248Q640N4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp248Q640N4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp248Q640N4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp248Q640N4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp248Q640N4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp248Q640N4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Zfp248Q640N4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp248Q640N4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp248Q640N4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp248Q640N4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Zfp248Q640N4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp248Q640N4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp248Q640N4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp248Q640N4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp248Q640N4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp248Q640N4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Zfp248Q640N4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Zfp248Q640N4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp248Q640N4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp248Q640N4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp248Q640N4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Zfp248Q640N4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Zfp248Q640N4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Zfp248Q640N4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Zfp248Q640N4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Zfp248Q640N4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Zfp248Q640N4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Zfp248Q640N4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp248Q640N4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp248Q640N4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp248Q640N4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp248Q640N4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zfp248Q640N4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Zfp248Q640N4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Zfp248Q640N4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp248Q640N4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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