Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctr9Q62018 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctr9Q62018 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms