Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarcd1Q61466 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarcd1Q61466 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarcd1Q61466 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarcd1Q61466 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarcd1Q61466 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarcd1Q61466 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarcd1Q61466 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Smarcd1Q61466 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarcd1Q61466 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarcd1Q61466 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarcd1Q61466 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarcd1Q61466 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcd1Q61466 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcd1Q61466 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcd1Q61466 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcd1Q61466 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcd1Q61466 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcd1Q61466 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcd1Q61466 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcd1Q61466 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcd1Q61466 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcd1Q61466 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcd1Q61466 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcd1Q61466 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcd1Q61466 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcd1Q61466 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcd1Q61466 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms