Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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PcolceQ61398 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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PcolceQ61398 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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PcolceQ61398 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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PcolceQ61398 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PcolceQ61398 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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PcolceQ61398 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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PcolceQ61398 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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PcolceQ61398 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcolceQ61398 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcolceQ61398 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcolceQ61398 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcolceQ61398 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcolceQ61398 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PcolceQ61398 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcolceQ61398 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcolceQ61398 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcolceQ61398 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcolceQ61398 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcolceQ61398 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcolceQ61398 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcolceQ61398 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcolceQ61398 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcolceQ61398 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PcolceQ61398 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PcolceQ61398 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcolceQ61398 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PcolceQ61398 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PcolceQ61398 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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