Protein–RNA interactions for Protein: Q61144

Psen2, Presenilin-2, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen2Q61144 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psen2Q61144 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psen2Q61144 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psen2Q61144 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psen2Q61144 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psen2Q61144 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Psen2Q61144 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Psen2Q61144 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Psen2Q61144 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Psen2Q61144 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psen2Q61144 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psen2Q61144 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psen2Q61144 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psen2Q61144 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psen2Q61144 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psen2Q61144 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psen2Q61144 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psen2Q61144 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psen2Q61144 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psen2Q61144 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psen2Q61144 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psen2Q61144 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psen2Q61144 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psen2Q61144 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psen2Q61144 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psen2Q61144 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psen2Q61144 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psen2Q61144 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psen2Q61144 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Psen2Q61144 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psen2Q61144 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psen2Q61144 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psen2Q61144 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psen2Q61144 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psen2Q61144 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psen2Q61144 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psen2Q61144 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psen2Q61144 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psen2Q61144 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psen2Q61144 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psen2Q61144 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psen2Q61144 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms