Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnfrsf8Q60846 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf8Q60846 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms