Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnot7Q60809 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cnot7Q60809 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnot7Q60809 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms