Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atf3Q60765 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atf3Q60765 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atf3Q60765 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms