Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc5a6Q5U4D8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc5a6Q5U4D8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms