Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW75

Ssh2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh2Q5SW75 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ssh2Q5SW75 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ssh2Q5SW75 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ssh2Q5SW75 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ssh2Q5SW75 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ssh2Q5SW75 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ssh2Q5SW75 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ssh2Q5SW75 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ssh2Q5SW75 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ssh2Q5SW75 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ssh2Q5SW75 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Ssh2Q5SW75 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ssh2Q5SW75 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Ssh2Q5SW75 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Ssh2Q5SW75 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ssh2Q5SW75 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ssh2Q5SW75 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ssh2Q5SW75 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ssh2Q5SW75 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ssh2Q5SW75 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ssh2Q5SW75 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ssh2Q5SW75 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ssh2Q5SW75 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ssh2Q5SW75 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ssh2Q5SW75 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ssh2Q5SW75 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ssh2Q5SW75 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ssh2Q5SW75 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ssh2Q5SW75 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ssh2Q5SW75 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ssh2Q5SW75 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ssh2Q5SW75 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ssh2Q5SW75 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ssh2Q5SW75 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ssh2Q5SW75 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Ssh2Q5SW75 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ssh2Q5SW75 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ssh2Q5SW75 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ssh2Q5SW75 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ssh2Q5SW75 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ssh2Q5SW75 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ssh2Q5SW75 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ssh2Q5SW75 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ssh2Q5SW75 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ssh2Q5SW75 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ssh2Q5SW75 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ssh2Q5SW75 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ssh2Q5SW75 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ssh2Q5SW75 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ssh2Q5SW75 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ssh2Q5SW75 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ssh2Q5SW75 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ssh2Q5SW75 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms