Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ankrd40Q5SUE8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ankrd40Q5SUE8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms