Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trdv2-2Q5R1A4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trdv2-2Q5R1A4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trdv2-2Q5R1A4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trdv2-2Q5R1A4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms