Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBX1

Cobl, Protein cordon-bleu, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoblQ5NBX1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CoblQ5NBX1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CoblQ5NBX1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CoblQ5NBX1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms