Protein–RNA interactions for Protein: Q5M8N4

Sdr39u1, Epimerase family protein SDR39U1, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr39u1Q5M8N4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sdr39u1Q5M8N4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdr39u1Q5M8N4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms