Protein–RNA interactions for Protein: Q5F201

Cfap52, Cilia- and flagella-associated protein 52, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap52Q5F201 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cfap52Q5F201 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap52Q5F201 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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