Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prkaa1Q5EG47 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prkaa1Q5EG47 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms