Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp22Q5DU02 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp22Q5DU02 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms