Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrig2Q52KR2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrig2Q52KR2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrig2Q52KR2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Lrig2Q52KR2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Lrig2Q52KR2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrig2Q52KR2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrig2Q52KR2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms