Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJN1

C1qtnf9, Complement C1q and tumor necrosis factor-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf9Q4ZJN1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1qtnf9Q4ZJN1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms