Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ddx49Q4FZF3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ddx49Q4FZF3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx49Q4FZF3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms