Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmub2Q3V209 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms