Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrc43Q3V0L5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrc43Q3V0L5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrc43Q3V0L5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrc43Q3V0L5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrc43Q3V0L5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc43Q3V0L5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc43Q3V0L5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc43Q3V0L5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc43Q3V0L5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc43Q3V0L5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc43Q3V0L5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc43Q3V0L5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc43Q3V0L5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc43Q3V0L5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc43Q3V0L5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc43Q3V0L5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc43Q3V0L5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
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