Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C1

Zmat1, Zinc finger matrin-type protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat1Q3V0C1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zmat1Q3V0C1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Zmat1Q3V0C1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Zmat1Q3V0C1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zmat1Q3V0C1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zmat1Q3V0C1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zmat1Q3V0C1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zmat1Q3V0C1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zmat1Q3V0C1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zmat1Q3V0C1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zmat1Q3V0C1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zmat1Q3V0C1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zmat1Q3V0C1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zmat1Q3V0C1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zmat1Q3V0C1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zmat1Q3V0C1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zmat1Q3V0C1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zmat1Q3V0C1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zmat1Q3V0C1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zmat1Q3V0C1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zmat1Q3V0C1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zmat1Q3V0C1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zmat1Q3V0C1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zmat1Q3V0C1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zmat1Q3V0C1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zmat1Q3V0C1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Zmat1Q3V0C1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zmat1Q3V0C1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zmat1Q3V0C1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zmat1Q3V0C1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zmat1Q3V0C1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zmat1Q3V0C1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zmat1Q3V0C1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zmat1Q3V0C1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zmat1Q3V0C1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zmat1Q3V0C1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zmat1Q3V0C1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zmat1Q3V0C1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms