Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc160Q3UYG1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc160Q3UYG1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms