Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm5aQ3UXZ9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm5aQ3UXZ9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm5aQ3UXZ9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm5aQ3UXZ9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm5aQ3UXZ9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm5aQ3UXZ9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm5aQ3UXZ9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm5aQ3UXZ9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm5aQ3UXZ9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm5aQ3UXZ9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm5aQ3UXZ9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm5aQ3UXZ9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm5aQ3UXZ9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm5aQ3UXZ9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm5aQ3UXZ9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm5aQ3UXZ9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm5aQ3UXZ9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm5aQ3UXZ9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm5aQ3UXZ9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm5aQ3UXZ9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm5aQ3UXZ9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm5aQ3UXZ9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm5aQ3UXZ9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm5aQ3UXZ9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm5aQ3UXZ9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm5aQ3UXZ9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm5aQ3UXZ9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm5aQ3UXZ9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm5aQ3UXZ9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm5aQ3UXZ9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm5aQ3UXZ9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kdm5aQ3UXZ9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kdm5aQ3UXZ9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kdm5aQ3UXZ9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kdm5aQ3UXZ9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Kdm5aQ3UXZ9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Kdm5aQ3UXZ9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kdm5aQ3UXZ9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms