Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc114Q3UX62 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc114Q3UX62 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms