Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nr1d1Q3UV55 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms