Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUY6

Prom2, Prominin-2, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom2Q3UUY6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prom2Q3UUY6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prom2Q3UUY6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prom2Q3UUY6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prom2Q3UUY6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prom2Q3UUY6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prom2Q3UUY6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prom2Q3UUY6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prom2Q3UUY6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prom2Q3UUY6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Prom2Q3UUY6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prom2Q3UUY6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prom2Q3UUY6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Prom2Q3UUY6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prom2Q3UUY6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prom2Q3UUY6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prom2Q3UUY6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Prom2Q3UUY6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prom2Q3UUY6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prom2Q3UUY6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prom2Q3UUY6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prom2Q3UUY6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prom2Q3UUY6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prom2Q3UUY6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prom2Q3UUY6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Prom2Q3UUY6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prom2Q3UUY6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prom2Q3UUY6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prom2Q3UUY6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prom2Q3UUY6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Prom2Q3UUY6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Prom2Q3UUY6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prom2Q3UUY6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prom2Q3UUY6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prom2Q3UUY6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prom2Q3UUY6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prom2Q3UUY6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Prom2Q3UUY6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Prom2Q3UUY6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prom2Q3UUY6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prom2Q3UUY6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms