Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrc1Q3UPH1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc1Q3UPH1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms