Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrc4Q3UP24 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrc4Q3UP24 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrc4Q3UP24 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrc4Q3UP24 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrc4Q3UP24 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrc4Q3UP24 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrc4Q3UP24 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrc4Q3UP24 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrc4Q3UP24 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrc4Q3UP24 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrc4Q3UP24 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrc4Q3UP24 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrc4Q3UP24 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrc4Q3UP24 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrc4Q3UP24 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrc4Q3UP24 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrc4Q3UP24 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrc4Q3UP24 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrc4Q3UP24 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrc4Q3UP24 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrc4Q3UP24 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrc4Q3UP24 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrc4Q3UP24 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrc4Q3UP24 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrc4Q3UP24 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrc4Q3UP24 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrc4Q3UP24 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrc4Q3UP24 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrc4Q3UP24 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrc4Q3UP24 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrc4Q3UP24 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrc4Q3UP24 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrc4Q3UP24 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlrc4Q3UP24 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlrc4Q3UP24 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlrc4Q3UP24 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlrc4Q3UP24 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlrc4Q3UP24 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrc4Q3UP24 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms