Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc34Q3UI66 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms