Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zswim8Q3UHH1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Zswim8Q3UHH1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zswim8Q3UHH1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zswim8Q3UHH1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zswim8Q3UHH1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zswim8Q3UHH1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zswim8Q3UHH1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zswim8Q3UHH1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zswim8Q3UHH1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zswim8Q3UHH1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms