Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rnft2Q3UF64 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnft2Q3UF64 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnft2Q3UF64 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms