Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Yipf3Q3UDR8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Yipf3Q3UDR8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Yipf3Q3UDR8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Yipf3Q3UDR8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms