Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pid1Q3UBG2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pid1Q3UBG2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pid1Q3UBG2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pid1Q3UBG2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pid1Q3UBG2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pid1Q3UBG2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pid1Q3UBG2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pid1Q3UBG2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pid1Q3UBG2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pid1Q3UBG2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pid1Q3UBG2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pid1Q3UBG2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pid1Q3UBG2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pid1Q3UBG2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pid1Q3UBG2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pid1Q3UBG2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pid1Q3UBG2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pid1Q3UBG2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pid1Q3UBG2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pid1Q3UBG2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Pid1Q3UBG2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pid1Q3UBG2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pid1Q3UBG2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pid1Q3UBG2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pid1Q3UBG2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Pid1Q3UBG2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pid1Q3UBG2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pid1Q3UBG2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pid1Q3UBG2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Pid1Q3UBG2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pid1Q3UBG2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pid1Q3UBG2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms