Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vars2Q3U2A8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vars2Q3U2A8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vars2Q3U2A8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vars2Q3U2A8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vars2Q3U2A8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vars2Q3U2A8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vars2Q3U2A8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms