Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3TTL0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3TTL0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3TTL0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3TTL0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3TTL0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3TTL0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3TTL0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3TTL0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3TTL0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3TTL0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3TTL0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3TTL0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3TTL0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3TTL0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3TTL0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3TTL0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3TTL0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3TTL0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3TTL0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3TTL0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3TTL0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3TTL0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3TTL0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q3TTL0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q3TTL0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q3TTL0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q3TTL0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q3TTL0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q3TTL0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q3TTL0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q3TTL0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q3TTL0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q3TTL0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q3TTL0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Q3TTL0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q3TTL0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3TTL0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3TTL0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3TTL0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3TTL0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3TTL0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3TTL0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms