Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp39Q3TIX9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp39Q3TIX9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp39Q3TIX9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp39Q3TIX9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp39Q3TIX9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp39Q3TIX9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp39Q3TIX9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp39Q3TIX9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp39Q3TIX9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp39Q3TIX9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp39Q3TIX9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp39Q3TIX9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp39Q3TIX9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp39Q3TIX9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp39Q3TIX9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp39Q3TIX9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp39Q3TIX9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp39Q3TIX9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp39Q3TIX9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp39Q3TIX9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp39Q3TIX9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp39Q3TIX9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp39Q3TIX9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp39Q3TIX9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp39Q3TIX9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp39Q3TIX9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp39Q3TIX9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp39Q3TIX9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp39Q3TIX9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp39Q3TIX9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp39Q3TIX9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp39Q3TIX9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp39Q3TIX9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp39Q3TIX9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp39Q3TIX9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms