Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Treml4Q3LRV9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Treml4Q3LRV9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Treml4Q3LRV9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Treml4Q3LRV9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Treml4Q3LRV9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Treml4Q3LRV9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Treml4Q3LRV9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Treml4Q3LRV9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Treml4Q3LRV9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Treml4Q3LRV9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Treml4Q3LRV9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Treml4Q3LRV9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Treml4Q3LRV9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Treml4Q3LRV9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Treml4Q3LRV9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Treml4Q3LRV9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Treml4Q3LRV9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Treml4Q3LRV9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Treml4Q3LRV9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Treml4Q3LRV9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Treml4Q3LRV9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Treml4Q3LRV9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Treml4Q3LRV9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Treml4Q3LRV9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Treml4Q3LRV9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Treml4Q3LRV9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Treml4Q3LRV9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Treml4Q3LRV9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Treml4Q3LRV9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Treml4Q3LRV9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Treml4Q3LRV9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Treml4Q3LRV9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Treml4Q3LRV9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Treml4Q3LRV9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Treml4Q3LRV9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Treml4Q3LRV9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Treml4Q3LRV9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Treml4Q3LRV9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Treml4Q3LRV9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Treml4Q3LRV9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms