Protein–RNA interactions for Protein: Q3LAC4

Prex2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prex2Q3LAC4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Prex2Q3LAC4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Prex2Q3LAC4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Prex2Q3LAC4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Prex2Q3LAC4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Prex2Q3LAC4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Prex2Q3LAC4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Prex2Q3LAC4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Prex2Q3LAC4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Prex2Q3LAC4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Prex2Q3LAC4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Prex2Q3LAC4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Prex2Q3LAC4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Prex2Q3LAC4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Prex2Q3LAC4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Prex2Q3LAC4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Prex2Q3LAC4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Prex2Q3LAC4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Prex2Q3LAC4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Prex2Q3LAC4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prex2Q3LAC4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prex2Q3LAC4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prex2Q3LAC4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prex2Q3LAC4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prex2Q3LAC4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prex2Q3LAC4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prex2Q3LAC4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prex2Q3LAC4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prex2Q3LAC4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Prex2Q3LAC4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prex2Q3LAC4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prex2Q3LAC4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prex2Q3LAC4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prex2Q3LAC4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prex2Q3LAC4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prex2Q3LAC4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prex2Q3LAC4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prex2Q3LAC4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prex2Q3LAC4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prex2Q3LAC4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prex2Q3LAC4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Prex2Q3LAC4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prex2Q3LAC4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prex2Q3LAC4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prex2Q3LAC4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prex2Q3LAC4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prex2Q3LAC4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prex2Q3LAC4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prex2Q3LAC4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prex2Q3LAC4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prex2Q3LAC4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prex2Q3LAC4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prex2Q3LAC4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Prex2Q3LAC4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Prex2Q3LAC4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Prex2Q3LAC4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Prex2Q3LAC4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Prex2Q3LAC4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms