Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trpm1Q2TV84 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trpm1Q2TV84 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trpm1Q2TV84 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Trpm1Q2TV84 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trpm1Q2TV84 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trpm1Q2TV84 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trpm1Q2TV84 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trpm1Q2TV84 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trpm1Q2TV84 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trpm1Q2TV84 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trpm1Q2TV84 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trpm1Q2TV84 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trpm1Q2TV84 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trpm1Q2TV84 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trpm1Q2TV84 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trpm1Q2TV84 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trpm1Q2TV84 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trpm1Q2TV84 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trpm1Q2TV84 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trpm1Q2TV84 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trpm1Q2TV84 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trpm1Q2TV84 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trpm1Q2TV84 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trpm1Q2TV84 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trpm1Q2TV84 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trpm1Q2TV84 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trpm1Q2TV84 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trpm1Q2TV84 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trpm1Q2TV84 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trpm1Q2TV84 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trpm1Q2TV84 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trpm1Q2TV84 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trpm1Q2TV84 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trpm1Q2TV84 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trpm1Q2TV84 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trpm1Q2TV84 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trpm1Q2TV84 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trpm1Q2TV84 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trpm1Q2TV84 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trpm1Q2TV84 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trpm1Q2TV84 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trpm1Q2TV84 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Trpm1Q2TV84 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trpm1Q2TV84 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trpm1Q2TV84 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trpm1Q2TV84 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trpm1Q2TV84 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trpm1Q2TV84 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trpm1Q2TV84 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trpm1Q2TV84 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trpm1Q2TV84 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trpm1Q2TV84 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Trpm1Q2TV84 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trpm1Q2TV84 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms