Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDG1

Rhox4c, MCG125587, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4cQ2MDG1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhox4cQ2MDG1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox4cQ2MDG1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms