Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPTX1Q15818 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPTX1Q15818 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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