Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGM9

Rtel1, Regulator of telomere elongation helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtel1Q0VGM9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtel1Q0VGM9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtel1Q0VGM9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms