Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim24Q0VG18 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim24Q0VG18 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim24Q0VG18 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim24Q0VG18 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim24Q0VG18 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim24Q0VG18 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim24Q0VG18 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim24Q0VG18 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim24Q0VG18 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim24Q0VG18 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim24Q0VG18 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim24Q0VG18 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim24Q0VG18 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim24Q0VG18 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim24Q0VG18 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim24Q0VG18 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim24Q0VG18 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim24Q0VG18 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim24Q0VG18 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim24Q0VG18 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim24Q0VG18 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim24Q0VG18 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim24Q0VG18 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim24Q0VG18 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim24Q0VG18 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim24Q0VG18 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim24Q0VG18 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim24Q0VG18 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim24Q0VG18 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim24Q0VG18 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim24Q0VG18 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smim24Q0VG18 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smim24Q0VG18 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smim24Q0VG18 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim24Q0VG18 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms