Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rundc1Q0VDN7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rundc1Q0VDN7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms